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芽孢杆菌，细菌的一科，能形成芽孢（内生孢子）的杆菌或球菌。包括芽孢杆菌属、芽孢乳杆菌属、梭菌属、脱硫肠状菌属和芽孢八叠球菌属等。它们对外界有害因子抵抗力强，分布广，存在于土壤、水、空气以及动物肠道等处。芽孢杆菌（杆菌科的一属细菌。
绝大多数是一个菌体仅形成一个芽孢芽孢位于菌体内，为革兰氏阳性菌。内含DNA、RNA、可能与 DNA相联系的特异芽孢蛋白质以及合成蛋白质和产生能量的系统。
凝结芽孢杆菌还具有以下多重药理作用：1.预防术后肠功能紊乱，促进术后排气2.治疗病毒性腹泻3.治疗腹泻型肠易激综合征、溃疡性结肠炎4.防治抗生素相关性腹泻及伪膜性肠炎5.肝硬化等慢性肝病的联合治疗6.联合三联方根除幽门螺杆菌7.防治手足口病、新生儿黄疸的防治、防治小儿湿疹8.治疗细菌性阴道炎9.消除放化疗对肠道菌群和肠粘膜的破坏等。10.最后强调，凝结芽孢杆菌是唯一具有保水润肠作用，快速恢复肠道菌群平衡的益生菌。
芽孢杆菌对肠道不良环境的抵抗
动物的肠道内存在诸多不良的环境，如低pH值的胃酸、高浓度的胆盐、相对厌氧的环境等，这些环境不利于微生态制剂发挥作用。因此如何有效抵御这些不良环境的影响，是芽孢杆菌在动物体内发挥作用的前提。
芽孢在动物肠道中的萌发
另一方面，芽孢在不同试验动物肠道中的保留特性差异很大。在禽类中的定植时间要显著高于哺乳动物。
